但机器联军的主脑机器皇帝，创造性的想到养殖人类来充当生物电池的方法。它生产人类，然后将人类的肉体浸泡在营养液中，利用人体的碱基因对发电。当人类死亡后，他们的尸体便被回收，作为营养液循环利用……
出乎机器皇帝意料的是，长期陷入休眠的人类会在一段时间后陷入精神崩溃状态，进而诱发肉体的死亡。所以，机器皇帝建立了一个名为“矩阵”的网络世界，将人类的精神导入其中，从而延长这些“电池”的生命。在那里，人类的意识就像网游玩家一般生活在一个类似二十世纪九十年代的虚拟社会里，过着“幸福”、“和谐”的生活。
但是，只要是系统就会有漏洞，总有一些人类精神更为活跃，会发现自己生活在一个虚假的社会中，发现世界真实的模样。这些人就像病毒一般防不胜防。机械皇帝一方面使用杀毒软件“特工”来清理他们，一方面，他主动构建了一个名为“锡安”的反抗军基地，吸引所有“不安分”的人类聚集起来，为他们编造出一个“救世主”的神话，让他们团结在一起，然后自己再定期进行清理围剿。
当然，这个秘密只有少数存在知晓。而影片开始的时间段，则是已经重建了六次的锡安城。自以为为“自由”而战的人类反抗军，自以为“救世主”的人类领袖，一代代在机械皇帝自导自演的剧本中不断重复可歌可泣的悲壮故事，直到主角出现……
所有故事都有一根导火线，而《黑客帝国》故事的导火线就是夏恒马上就要见到的尼布甲尼撒船长墨菲斯。不久前，墨菲斯在矩阵中见到了一个名为“先知”的程序，并从她那里听到了“救世主”的传说。从先知那里回来之后，墨菲斯就如变了一个人般，疯狂宣传和鼓吹“救世主”的言论，并一再违背锡安军事主管的命令深入矩阵去寻找传说中的“救世主”。
多数人认为他疯了，曾经的好朋友们也纷纷离他而去，除了少数拥簇者之外，此时的墨菲斯在城中并不受待见。若非其曾经的累累战功，可能早就被罢免了船长职务。
“船长已经找到了‘救世主’的痕迹，很快我们就将展开行动，所以与特工的遭遇是不可避免的，我们需要补充大量人手，所以你遇上了好机会！”坦克兴奋的说，浑然不顾自己大哥在一旁的眼色。
多泽提心吊胆的叹了一口气，以墨菲斯船长现在的名声，招人本就困难，好不容易遇上一个，要再被“特工”的名头给吓跑了，那可就得不偿失了。要知道，目前所知的记录中，还没有任何反抗者能在矩阵中战胜特工。
“听起来似乎很危险！”夏恒做出一副担忧的模样。
“不……其实没那么危险，矩阵世界比想象中的要大的多，我们可以找到足够的漏洞来突破它并安全返回！”多泽悄无声息的将自己弟弟从夏恒身边撤开，免得自己这个傻兄弟继续拆台，“而且，我们船上有锡安最优秀的战士——崔妮蒂，她是少数能与特工正面对抗的角色！”
“正面对抗？”夏恒心里冷笑但脸上却露出仰慕的表情，崔妮蒂确实优秀，但在特工面前还不是个儿。看在多泽这么卖力坑自己的份儿上，以后弄死他的时候就不需要内疚了。
“算……算是吧，她已经数次从特工手中逃脱了！”多泽似乎也觉得自己吹牛吹过了。
场面……略显尴尬。
“没关系，无论有多大的风险，我都坚信墨菲斯说的是正确的。这世上就没有不流血得来的和平，如果寻找‘救世主’的伟大事业需要牺牲的话，那就从我开始好了！”夏恒这一刻感觉自己如被谭嗣同附体，人性的光辉充溢心间。
“啪啪啪……”掌声从前方传来，一身暗红色船长服的墨菲斯一边鼓掌，一边露出赞许的神色，“只有这样无畏而睿智的勇士，才能为锡安迎来永久的解放！”
夏恒心下不由一乐，眼神儿快就是好，自己这次装得值了。要知道，墨菲斯对自己船员的唯一要求就是——“你必须无条件的相信我！”
“墨……墨菲斯船长，见到您很荣幸！”夏恒露出一副脑残粉的模样。
“年轻人，你叫什么名字？”
“艾帕克，九岁那年被从矩阵中拯救出来！”多泽在一旁解释道，意思是想告诉墨菲斯，这小子是完全的自己人，值得信任。
“那么艾帕克……你认为‘救世主’是真实存在的么？”墨菲斯很严肃的问。
夏恒知道，这就算自己上岗前的政治审查了，这是一个上纲上线的问题，没有第二个答案。
“没错，船长，我对此深信不疑，我们锡安需要一名战无不胜的英雄引导我们走向胜利，而这个人一定是存在的！”夏恒斩钉截铁的说道。
“是个好小伙儿，我接纳你成为我的船员！”墨菲斯认可的点了点头，“不过在此之前，你还需要经过几项测试，来判断你能在我们的船上做些什么？”
“听从您的命令，船长！”夏恒像军人一样站的笔直，若是墨菲斯有好感度，估计此刻绝对是爆表了。
于是，在多泽与坦克惊讶的目光里，夏恒就这样利落的通过了“难缠的墨菲斯”这一关，轻松写意的登上了尼布甲尼撒。
“唔，船长，是新人么，我们已经很久没有得到新人补充了！”一个面容有几分营养不良的小个子正在船上调试设备，见到夏恒后不由吹了个口哨。
“没错，茅斯，他和我们拥有共同而崇高的追求！”墨菲斯很严肃的说，他已经得不到认同很久了，所以遇到夏恒后难免有几分激动，“茅斯，去启动学习模拟设备，我们要对艾帕克做一些基础测试！”
“没问题，船长！”茅斯打了个响指，利落的起身收拾起矩阵连接设备，调试的间隙还不忘朝夏恒打招呼，“嗨，艾帕克，我叫茅斯，所以大家都喜欢叫我耗子，我是这船上的接线员！”
所谓接线员，就是将反抗军接入或导出矩阵的人员，是一项很重要的后勤工作。尤其是当你在矩阵中遭遇特工的时候，利落的接线员才能救你一命。
“嗨，茅斯，艾德里克•艾帕克，你可以直接称呼我为艾帕克！”夏恒微笑着打了个招呼，人生经历告诉他，后勤人员是绝对绝对不可以得罪冒犯的。
就在几人说话的间隙，船上的其他人员也纷纷从船舱里走了出来，其中最引人注意的自然就是英姿飒爽的崔妮蒂，短发皮衣，冷冷的冰山女王范儿让夏恒都不由心中荡漾了一下。
“喂，哥们儿你可要悠着点儿，这姐们儿可比看上去更不好惹！”坦克凑在夏恒耳边小声嘀咕道。
“明了，我就看看！”夏恒给了他一个男人都懂的眼神，却不料回头就发现崔妮蒂一脸杀气腾腾的看着自己……估摸这听力至少六级水准。
“咕咚！”坦克喉部发出吞咽声，随即做出一副老神自在的模样离夏恒远远的。